Unul din scopurile principale ale urmăririi penale este descoperirea și fixarea probelor comiterii infracțiunii și identificarea persoanelor care au comis-o. Uneori activitatea operativă de investigații poate chiar preîntâmpina comiterea unei infracțiuni. Activitatea operativă de investigații este o activitate a organelor de drept exercitată în baza legii. Legea stabilește următoarele feluri de activitate operativă de investigații: filajul, filmarea ascunsă, înregistrarea ascunsă, activitatea ofițerilor sub acoperire, provocare, procurare sub control operativ, instalarea dispozitivelor capcane, examinarea secretă a obiectivelor, teritoriilor, transporturilor și încăperilor, activitatea operativă în locurile de detenție și la locul de muncă, obținerea informațiilor din sursele operative inclusiv prin informatori etc.
Cea mai complicată este activitatea operativă de investigații la locul de muncă și examinarea operativă a încăperilor. Deseori aceste date și informații obținute nu pot fi folosite ca probe și pot fi declarare inadmisibile din cauză restricțiilor procesual penale. Articolul 8 CEDO prevede dreptul ori cărei persoane la respectarea vieții private și de familie. Activitatea operativă de investigații trebuie să fie desfășurată în strictă conformitate cu Constituția RM, actele și tratatele internaționale și legislația.
Toate aceste activități operative de investigație trebuie să fie desfășurate de către ofițerii operativi cu o pregătire profesională superioară, altfel rezultatele activității vor fi nesatisfăcătoare. De obicei pregătirea unui astfel de ofițer poate dura până la 10 ani. Costul activității operative de investigații pentru bugetul public este o altă problemă cu care se confruntă organele de activitate operativă. Pentru desfășurarea eficientă acestei activități este nevoie de resursele financiare. Organele de drept au nevoie de tehnică și transportul necesar, ei au nevoie de încăperi operative și bani pentru a menține numărul necesar de informatori plătiți.
O altă problemă este activitatea operativă de investigații legată de infracțiunile comise de judecători, procurori, lucrătorii Guvernului, Parlamentului și alți funcționari de rang înalt. Ca regulă cu aceste infracțiuni tradițional se ocupa serviciul de informații și de securitate. Odată cu lichidarea competenței de a desfășura urmărirea penală, acest organ a rămas fără mijloacele necesare pentru controlul acestor organe și ca rezultat corupția crește în special în organele de stat.